38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0638 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1069    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 506 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  29.54 
 
 		 565 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  33.27 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  30.9 
 
 		 526 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  31.38 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  34.91 
 
 		 446 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  34.83 
 
 		 478 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  35.75 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  39.92 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  42.62 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  29.8 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  19.85 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  25.91 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  25.49 
 
 		 516 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  25.49 
 
 		 516 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.75 
 
 		 618 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  24.51 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  25 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  29.77 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  32.51 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.54 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  31.5 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  34.27 
 
 		 544 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  27.75 
 
 		 526 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  31.62 
 
 		 547 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  30.5 
 
 		 479 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 513 aa  50.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  28.65 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  25 
 
 		 618 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  26.89 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  24.53 
 
 		 532 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  21.58 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  24.68 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>