68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4094 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1013    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  41.6 
 
 		 616 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  46.57 
 
 		 526 aa  240  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  41.08 
 
 		 638 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  39.24 
 
 		 593 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  51.46 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  33.65 
 
 		 534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  35.11 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  27.6 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  38.6 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  37.79 
 
 		 516 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  37.79 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  31.06 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  37.21 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  37.21 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  37.21 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  21.56 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  35.26 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  43.56 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  26.05 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  27.81 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  28.46 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  31.28 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  27.8 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  26.97 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  40 
 
 		 727 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  28.19 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  30.73 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  29.58 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  29.86 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  25.1 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  29.58 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  29.37 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  35.96 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4047  hypothetical protein  34.27 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166199  normal  0.175884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  30.74 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  40.17 
 
 		 704 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  32.2 
 
 		 658 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  32.74 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  28.71 
 
 		 607 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  28.8 
 
 		 547 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  34.04 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  34.56 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  34.56 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  24.56 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  32.1 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0565  hypothetical protein  32.45 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  27.06 
 
 		 470 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  30.37 
 
 		 565 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  28.89 
 
 		 592 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  28.89 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  37.07 
 
 		 508 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.55 
 
 		 605 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  32.97 
 
 		 546 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  33.7 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  34.11 
 
 		 523 aa  47.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  32.97 
 
 		 546 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  33.63 
 
 		 506 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.57 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  34.48 
 
 		 567 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  29.25 
 
 		 557 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  35.14 
 
 		 726 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  31.14 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 553 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>