56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0410 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  100 
 
 
505 aa  997    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0402  glycosyltransferase  99.21 
 
 
505 aa  989    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1440  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1410  hypothetical protein  32.39 
 
 
508 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0655  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
493 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0954  glycosyl transferase family 39  29.76 
 
 
499 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1105  putative glycosyltransferase protein  30.78 
 
 
499 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00589779  normal  0.39875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  31.7 
 
 
497 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  31.12 
 
 
496 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0953  putative glycosyltransferase protein  31.59 
 
 
495 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452893  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1104  putative glycosyltransferase protein  31.84 
 
 
495 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.414123  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5017  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
497 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0917  hypothetical protein  29.43 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.654101  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3796  hypothetical protein  26.68 
 
 
506 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1869  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
498 aa  84.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3323  hypothetical protein  29.9 
 
 
597 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734418  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  31.15 
 
 
512 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  28.9 
 
 
537 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0372  hypothetical protein  29.51 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.231054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  29.51 
 
 
513 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  25.48 
 
 
487 aa  62.4  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  30.72 
 
 
506 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4458  hypothetical protein  25.64 
 
 
497 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0803216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1703  hypothetical protein  26.92 
 
 
541 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836092  normal  0.426921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  30.81 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1924  glycosyltransferase  35.33 
 
 
528 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  22.46 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  28.16 
 
 
510 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7373  hypothetical protein  26.17 
 
 
534 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
505 aa  53.5  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1664  hypothetical protein  26.4 
 
 
503 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  27.37 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0592  hypothetical protein  26.06 
 
 
516 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351332  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  23.79 
 
 
812 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  31.32 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  27.27 
 
 
526 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  23.86 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  27.8 
 
 
527 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3659  hypothetical protein  34.18 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3820  hypothetical protein  29.03 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  27.78 
 
 
493 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
636 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  23.38 
 
 
497 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4480  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
518 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.963285  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2617  putative membrane protein of unknown function  27.14 
 
 
535 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3542  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  23.93 
 
 
610 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.284365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  27.33 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
496 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  33.02 
 
 
544 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  22.27 
 
 
497 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7230  hypothetical protein  23.3 
 
 
583 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.57 
 
 
505 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  26.95 
 
 
473 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  27.03 
 
 
502 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  23.28 
 
 
465 aa  43.5  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>