56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3975 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
483 aa  972    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.69 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
513 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.26 
 
 
658 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  35.75 
 
 
492 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  25.42 
 
 
704 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.01 
 
 
618 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  33.9 
 
 
536 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  26.93 
 
 
726 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  28.33 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.62 
 
 
729 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  28.82 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  27.27 
 
 
478 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  31.45 
 
 
532 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  28.29 
 
 
618 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  25.93 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  23.86 
 
 
486 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  26.94 
 
 
727 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  25.31 
 
 
616 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
557 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  28.8 
 
 
494 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  21.78 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  32.87 
 
 
506 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  27.16 
 
 
593 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  32.54 
 
 
526 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  28.27 
 
 
508 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.92 
 
 
607 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  28.46 
 
 
655 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0565  hypothetical protein  30.2 
 
 
657 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  21.44 
 
 
516 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  21.44 
 
 
516 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  21.25 
 
 
516 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
636 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  27.78 
 
 
592 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  25.62 
 
 
655 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  29.13 
 
 
588 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1830  hypothetical protein  29.79 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1856  hypothetical protein  29.79 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837751  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  22.5 
 
 
546 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  21.21 
 
 
516 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1913  glycosyl transferase family 39  33.59 
 
 
528 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  28.24 
 
 
605 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  23.66 
 
 
534 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  24.11 
 
 
565 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  25 
 
 
557 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  28 
 
 
697 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  31.3 
 
 
544 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  25.48 
 
 
550 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  24.61 
 
 
531 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
560 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1914  glycosyl transferase family 39  34.62 
 
 
450 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.245587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.5 
 
 
575 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.56 
 
 
864 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  26.36 
 
 
522 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  26.36 
 
 
522 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>