24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5993 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  100 
 
 		 478 aa  909    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  54.4 
 
 		 446 aa  348  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  38.26 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  38.35 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  30.23 
 
 		 526 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  34.24 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  31.95 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  29.88 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  39.42 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0769  hypothetical protein  32.13 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0333554  hitchhiker  0.00590563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.53 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  34.09 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  26.86 
 
 		 726 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  25 
 
 		 658 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  29.97 
 
 		 526 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 513 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  23.38 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.98 
 
 		 618 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  24.4 
 
 		 704 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  24.64 
 
 		 729 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  26.22 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 		 510 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>