30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0769 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0769  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1102    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0333554  hitchhiker  0.00590563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  33.79 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  30.17 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.61 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  28.6 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  25.82 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  26.34 
 
 		 729 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  28.89 
 
 		 565 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  25.76 
 
 		 704 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  31.03 
 
 		 508 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  30.41 
 
 		 618 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  33.56 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  37.23 
 
 		 567 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  33.14 
 
 		 523 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  20.63 
 
 		 531 aa  51.2  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  27 
 
 		 531 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  29.48 
 
 		 727 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  35.88 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  27.18 
 
 		 544 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  26.47 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  35.07 
 
 		 655 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 492 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  35.9 
 
 		 544 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  23.56 
 
 		 516 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  36.9 
 
 		 655 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  22.69 
 
 		 507 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  28.64 
 
 		 592 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>