48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1943 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  100 
 
 		 726 aa  1444    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  72.84 
 
 		 729 aa  1043    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  42.37 
 
 		 704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  35.34 
 
 		 658 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.49 
 
 		 618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  27.21 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 510 aa  91.3  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 		 753 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  21.64 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  33.57 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 825 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  31.7 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  34.75 
 
 		 996 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  27.1 
 
 		 592 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  25.59 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 483 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  28.23 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  36.11 
 
 		 998 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2971  membrane-like protein  28.64 
 
 		 544 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  23.32 
 
 		 517 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  31.52 
 
 		 565 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  23.75 
 
 		 546 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  26.25 
 
 		 531 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  30.87 
 
 		 873 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  36.26 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  28.15 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  23.53 
 
 		 528 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  26.6 
 
 		 516 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  32.39 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 677 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  26.6 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  38.46 
 
 		 717 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  26.6 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  26.6 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  23.08 
 
 		 528 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  31.87 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  26.6 
 
 		 516 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  29.67 
 
 		 509 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  30.82 
 
 		 608 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  33.98 
 
 		 535 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  28.96 
 
 		 593 aa  45.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  28.65 
 
 		 486 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  35.24 
 
 		 533 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  35.24 
 
 		 533 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  32.03 
 
 		 616 aa  44.3  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>