22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1047 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  73.95 
 
 		 825 aa  1056    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 753 aa  1468    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 677 aa  195  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  40 
 
 		 704 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  39.16 
 
 		 729 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3709  glycosyl transferase family 39  28.87 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 682 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  42.53 
 
 		 998 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  37.06 
 
 		 726 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  36.73 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  35.56 
 
 		 658 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  35.71 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  32.41 
 
 		 996 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  31.3 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  32.39 
 
 		 727 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  35.85 
 
 		 707 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  36.08 
 
 		 717 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  37 
 
 		 1043 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0334  glycosyltransferase  38.27 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184181  normal  0.020995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3837  hypothetical protein  31.68 
 
 		 573 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  29.81 
 
 		 580 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>