24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4131 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 677 aa  1351    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 825 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3709  glycosyl transferase family 39  29.04 
 
 		 576 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 		 682 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  23.03 
 
 		 1391 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  34 
 
 		 727 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  24.74 
 
 		 2679 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  32.59 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  34.69 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  34.69 
 
 		 610 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  34.62 
 
 		 704 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 		 998 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  29.86 
 
 		 996 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  32.41 
 
 		 729 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1043 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  33.04 
 
 		 707 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  28.76 
 
 		 658 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  35.11 
 
 		 726 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  23.95 
 
 		 717 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  24.31 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 560 aa  44.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  30.21 
 
 		 812 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>