11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2478 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  64.04 
 
 		 707 aa  898    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  100 
 
 		 1043 aa  2061    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  30.3 
 
 		 998 aa  327  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  30.42 
 
 		 996 aa  278  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2543  hypothetical protein  74.02 
 
 		 138 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.299266  normal  0.0921107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  30.47 
 
 		 727 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  31.16 
 
 		 618 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 677 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 753 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  29.11 
 
 		 929 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 682 aa  45.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>