26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2634 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  69.75 
 
 
930 aa  1070    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  44.73 
 
 
914 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  100 
 
 
929 aa  1837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  44.74 
 
 
909 aa  675    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  24.46 
 
 
694 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  25.76 
 
 
624 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  26.17 
 
 
711 aa  97.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  24.51 
 
 
678 aa  93.6  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  26.34 
 
 
827 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6412  hypothetical protein  25.23 
 
 
725 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  26.86 
 
 
728 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  25.26 
 
 
712 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  30.2 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2589  hypothetical protein  36.75 
 
 
559 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325004  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  29.52 
 
 
723 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  28.57 
 
 
587 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  24.11 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  26.41 
 
 
721 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  22.2 
 
 
736 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  24.6 
 
 
564 aa  68.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  29.41 
 
 
708 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1658  hypothetical protein  30.04 
 
 
553 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  27.32 
 
 
998 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  25.39 
 
 
715 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  29.11 
 
 
1043 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  27.8 
 
 
568 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>