28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0850 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  64.12 
 
 		 728 aa  897    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1443    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  33.18 
 
 		 708 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  30.85 
 
 		 712 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  30.87 
 
 		 715 aa  231  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  28.31 
 
 		 723 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0851  hypothetical protein  69.92 
 
 		 665 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.170161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  22.86 
 
 		 739 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  20.65 
 
 		 736 aa  121  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  32.58 
 
 		 568 aa  89  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  27.52 
 
 		 909 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  22.96 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  25.78 
 
 		 607 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  28.87 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0977  hypothetical protein  32.05 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.396988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  26.28 
 
 		 604 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  27.51 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  26.02 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  24.09 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  25.96 
 
 		 827 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  25.65 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  26.25 
 
 		 679 aa  64.7  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  32.8 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  32.26 
 
 		 929 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  26.06 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  25.19 
 
 		 628 aa  52.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  24.94 
 
 		 599 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  43.55 
 
 		 617 aa  47  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>