28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2115 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  100 
 
 
694 aa  1418    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  24.37 
 
 
736 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  24.83 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  26.12 
 
 
914 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  25.19 
 
 
909 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  24.45 
 
 
712 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  31.73 
 
 
223 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  24.95 
 
 
827 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  22.53 
 
 
723 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  24.6 
 
 
929 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  24.79 
 
 
708 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  23.37 
 
 
721 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  23.89 
 
 
930 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  25.19 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  21.66 
 
 
728 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  22.49 
 
 
715 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  21.21 
 
 
678 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  28.48 
 
 
587 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  24.86 
 
 
711 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  23.55 
 
 
624 aa  57.4  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  21.74 
 
 
579 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6412  hypothetical protein  26.59 
 
 
725 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2589  hypothetical protein  29.03 
 
 
559 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325004  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  31.06 
 
 
564 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  25 
 
 
744 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  22.27 
 
 
568 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0977  hypothetical protein  21.74 
 
 
219 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.396988  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0456  hypothetical protein  21.43 
 
 
168 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12649  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>