19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2365 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1089    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  44.96 
 
 
711 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  44.53 
 
 
678 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  44.41 
 
 
587 aa  347  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6412  hypothetical protein  38.14 
 
 
725 aa  313  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2589  hypothetical protein  39.75 
 
 
559 aa  214  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325004  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  29.13 
 
 
914 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  28.37 
 
 
909 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  26.1 
 
 
827 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  22.3 
 
 
736 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  31.48 
 
 
694 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  25.7 
 
 
579 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  21.58 
 
 
739 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  24.19 
 
 
929 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  27.27 
 
 
624 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  21.69 
 
 
223 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  27.97 
 
 
930 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  25.72 
 
 
540 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  25.52 
 
 
708 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>