29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1838 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  67.82 
 
 		 708 aa  934    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1419    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  33.28 
 
 		 715 aa  328  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  31.23 
 
 		 728 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  30.85 
 
 		 721 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  29.03 
 
 		 723 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  25.66 
 
 		 739 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  23.37 
 
 		 736 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  27.41 
 
 		 827 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  27.99 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0977  hypothetical protein  38.37 
 
 		 219 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.396988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  27.58 
 
 		 540 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  24.45 
 
 		 694 aa  97.8  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  28.78 
 
 		 568 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  24.84 
 
 		 909 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  25.06 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  26.73 
 
 		 607 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  30.36 
 
 		 607 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  32.3 
 
 		 628 aa  55.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  25.81 
 
 		 635 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  29.41 
 
 		 585 aa  53.9  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3001  hypothetical protein  22.52 
 
 		 575 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  25.97 
 
 		 604 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  28.49 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  31.25 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  25.26 
 
 		 929 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0851  hypothetical protein  28.46 
 
 		 665 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.170161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  27.72 
 
 		 686 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>