21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1456 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  92.56 
 
 
635 aa  1150    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1243    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  43.81 
 
 
606 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  44.44 
 
 
606 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  42.15 
 
 
585 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  36.79 
 
 
604 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  40.25 
 
 
599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  39.19 
 
 
607 aa  326  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  40.3 
 
 
632 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  37.54 
 
 
607 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  39.43 
 
 
611 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  31.09 
 
 
686 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  32.37 
 
 
627 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  29.29 
 
 
679 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  27.41 
 
 
617 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  25.18 
 
 
579 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  32 
 
 
721 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  27.8 
 
 
540 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  28.49 
 
 
712 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  29.14 
 
 
708 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  20.84 
 
 
736 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>