22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3325 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 607 aa  1182    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  91.27 
 
 		 607 aa  1051    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  37.36 
 
 		 604 aa  356  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  39.12 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  39.77 
 
 		 606 aa  343  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  39.69 
 
 		 632 aa  339  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  39.29 
 
 		 585 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  40.2 
 
 		 606 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  37.84 
 
 		 686 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  37.42 
 
 		 632 aa  293  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  35.63 
 
 		 599 aa  290  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  37.93 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  30.38 
 
 		 679 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  32.09 
 
 		 627 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  30.03 
 
 		 617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  25.2 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  26.7 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  28.49 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  26.73 
 
 		 712 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  24.61 
 
 		 715 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  29.23 
 
 		 914 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 909 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>