17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1495 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1247    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  87.87 
 
 		 611 aa  1004    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  41.17 
 
 		 606 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  43.07 
 
 		 585 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  40.67 
 
 		 635 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  42.11 
 
 		 606 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  40.86 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  38.64 
 
 		 604 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  40.58 
 
 		 599 aa  352  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  37.74 
 
 		 607 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  38.2 
 
 		 607 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  33.5 
 
 		 686 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  31.11 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  28.91 
 
 		 679 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  28.83 
 
 		 617 aa  92  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  31.97 
 
 		 579 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  25.99 
 
 		 223 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>