23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6359 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  100 
 
 
604 aa  1211    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  39.97 
 
 
585 aa  357  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  36.85 
 
 
635 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  38.18 
 
 
607 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  36.35 
 
 
632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  38.63 
 
 
611 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  36.16 
 
 
607 aa  336  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  38.15 
 
 
632 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  35.92 
 
 
606 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  37.21 
 
 
599 aa  316  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  34.34 
 
 
686 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  35.67 
 
 
606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  30.99 
 
 
627 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  29.64 
 
 
679 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  28.14 
 
 
617 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  28.16 
 
 
223 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  23.55 
 
 
736 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  26.33 
 
 
723 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  29.63 
 
 
721 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  25.54 
 
 
715 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  25.97 
 
 
712 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  26.52 
 
 
579 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  27.13 
 
 
540 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>