25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3366 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  68.72 
 
 		 579 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1085    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  34.47 
 
 		 223 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  26.71 
 
 		 827 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  27.58 
 
 		 712 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  27.09 
 
 		 708 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  28.22 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  23.16 
 
 		 736 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  25.54 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  23.32 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  25.61 
 
 		 715 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  25.19 
 
 		 694 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  26.29 
 
 		 721 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  30.26 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  30.05 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  34.75 
 
 		 627 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  28.57 
 
 		 678 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  28.88 
 
 		 587 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  27.8 
 
 		 632 aa  50.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  26.49 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  26.71 
 
 		 635 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 711 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  24.85 
 
 		 606 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  23.7 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  27.13 
 
 		 604 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>