22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1491 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1254    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  92.56 
 
 		 632 aa  1134    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  43 
 
 		 606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  43.62 
 
 		 606 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  41.99 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  36.85 
 
 		 604 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  40.21 
 
 		 599 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  40.03 
 
 		 632 aa  330  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  39.97 
 
 		 611 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  38.77 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  37.14 
 
 		 607 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  31.76 
 
 		 686 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  31.19 
 
 		 627 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  29.1 
 
 		 679 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  27.59 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  25.06 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  32.8 
 
 		 721 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  25.81 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  29.14 
 
 		 708 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  26.53 
 
 		 540 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  20.8 
 
 		 736 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  26.01 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>