16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1457 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  87.87 
 
 
632 aa  968    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1206    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  40.42 
 
 
606 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  43.34 
 
 
585 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  41.5 
 
 
606 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  38.63 
 
 
604 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  39.8 
 
 
635 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  39.27 
 
 
632 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  39.75 
 
 
599 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  37.76 
 
 
607 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  37.5 
 
 
607 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  33.33 
 
 
686 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  29.5 
 
 
627 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  28.02 
 
 
679 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  27.41 
 
 
617 aa  87  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  25.57 
 
 
223 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>