18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1192    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  51.62 
 
 		 585 aa  515  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  40.07 
 
 		 635 aa  356  7.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  40.98 
 
 		 606 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  40.03 
 
 		 632 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  37.07 
 
 		 604 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  39.84 
 
 		 632 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  39.56 
 
 		 606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  38.7 
 
 		 611 aa  317  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  34.75 
 
 		 607 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  34.53 
 
 		 607 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  33.28 
 
 		 686 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  27.62 
 
 		 679 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  30.16 
 
 		 627 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  27.85 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  24.44 
 
 		 721 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  31.82 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  24.26 
 
 		 223 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>