22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4116 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 606 aa  1195    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  90.08 
 
 		 606 aa  1056    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  43.87 
 
 		 635 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  44.71 
 
 		 632 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  41.42 
 
 		 611 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  41.42 
 
 		 632 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  41.17 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  39.93 
 
 		 599 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  40.2 
 
 		 607 aa  347  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  38.7 
 
 		 607 aa  343  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  35.67 
 
 		 604 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  34.63 
 
 		 686 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  27.75 
 
 		 679 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  30.05 
 
 		 627 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  28.81 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  22.59 
 
 		 736 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  25.93 
 
 		 728 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  26.71 
 
 		 721 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  25.4 
 
 		 723 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  24.85 
 
 		 540 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  26.19 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  23.77 
 
 		 715 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>