31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4066 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1422    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  37.12 
 
 		 708 aa  364  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  32.77 
 
 		 712 aa  341  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  30.73 
 
 		 721 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  30.1 
 
 		 728 aa  234  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  30.69 
 
 		 723 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  26.24 
 
 		 739 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  24.79 
 
 		 736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  32.83 
 
 		 223 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  24.7 
 
 		 694 aa  88.6  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  29.43 
 
 		 827 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  26.22 
 
 		 568 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0977  hypothetical protein  36.47 
 
 		 219 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.396988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  27.46 
 
 		 628 aa  78.2  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  24.57 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  23.99 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  26.34 
 
 		 604 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  24.94 
 
 		 607 aa  62  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  36.94 
 
 		 929 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  30.17 
 
 		 686 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3001  hypothetical protein  19.66 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  27.01 
 
 		 679 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  30.62 
 
 		 909 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  24.74 
 
 		 607 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  31.58 
 
 		 914 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  24.28 
 
 		 606 aa  51.6  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  30.6 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  34.31 
 
 		 585 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  34.21 
 
 		 930 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  24.88 
 
 		 635 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  25.36 
 
 		 632 aa  43.9  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>