25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3559 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  91.27 
 
 
607 aa  1048    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1188    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  36.48 
 
 
604 aa  356  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  37.65 
 
 
635 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  38.23 
 
 
632 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  39.44 
 
 
606 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  38.29 
 
 
585 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  39.37 
 
 
606 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  36.59 
 
 
686 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  35.39 
 
 
599 aa  290  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  36.77 
 
 
632 aa  289  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  37.66 
 
 
611 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  32.24 
 
 
627 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  30.88 
 
 
679 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  29.69 
 
 
617 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  25.07 
 
 
721 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  25.12 
 
 
728 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  27.46 
 
 
708 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  25.85 
 
 
712 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  24.48 
 
 
715 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  30.46 
 
 
914 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  29.44 
 
 
909 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  25.44 
 
 
223 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  28.85 
 
 
579 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  25.81 
 
 
628 aa  43.9  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>