26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6445 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  100 
 
 
627 aa  1192    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  58.09 
 
 
679 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  35.36 
 
 
617 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  31.75 
 
 
604 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  33.16 
 
 
585 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  32.19 
 
 
635 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  31.73 
 
 
632 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  34.69 
 
 
607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  34.6 
 
 
607 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  31 
 
 
606 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  31.05 
 
 
606 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  30.33 
 
 
632 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  31.53 
 
 
599 aa  144  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  29.45 
 
 
611 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  31.98 
 
 
686 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  32.19 
 
 
628 aa  71.6  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  28.28 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  28.65 
 
 
223 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  28.33 
 
 
540 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  24.81 
 
 
723 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  28.21 
 
 
728 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  27.55 
 
 
721 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  25.75 
 
 
715 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  29.17 
 
 
708 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  26.34 
 
 
827 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  19.66 
 
 
736 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>