34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1718 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1630    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  27.43 
 
 
712 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  26.41 
 
 
579 aa  124  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  28.27 
 
 
708 aa  111  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  28.33 
 
 
909 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  26.06 
 
 
540 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  26.4 
 
 
728 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  29.35 
 
 
715 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  34.84 
 
 
223 aa  99  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  26.44 
 
 
914 aa  97.8  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  25.14 
 
 
694 aa  92  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  21.77 
 
 
736 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  26.2 
 
 
723 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  25.54 
 
 
721 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  20.39 
 
 
739 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  26.47 
 
 
929 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  34.76 
 
 
869 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  28.36 
 
 
930 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  33.1 
 
 
860 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  29.2 
 
 
564 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  35.97 
 
 
688 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  29.27 
 
 
734 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  27.34 
 
 
587 aa  52  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0977  hypothetical protein  30.5 
 
 
219 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.396988  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  36.03 
 
 
755 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  25.19 
 
 
607 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  27.85 
 
 
628 aa  49.3  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  31.29 
 
 
734 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  25.98 
 
 
678 aa  48.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  34.74 
 
 
751 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  25.39 
 
 
686 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  22.83 
 
 
624 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  25.68 
 
 
607 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  27.64 
 
 
711 aa  44.3  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>