23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0362 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1318    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  58.09 
 
 		 627 aa  532  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  33.69 
 
 		 617 aa  206  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  29.66 
 
 		 604 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  29.19 
 
 		 606 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  34.06 
 
 		 607 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  29.78 
 
 		 635 aa  161  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  33.49 
 
 		 607 aa  161  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  30.73 
 
 		 585 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  29.55 
 
 		 632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  27.96 
 
 		 606 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  29.04 
 
 		 599 aa  133  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  28.19 
 
 		 611 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  28.57 
 
 		 632 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  27.62 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  31.03 
 
 		 628 aa  77.4  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  26.45 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  26.82 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  24.26 
 
 		 723 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  37.65 
 
 		 715 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  32.05 
 
 		 728 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  33.11 
 
 		 540 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>