21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2493 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  100 
 
 
739 aa  1504    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  51.89 
 
 
736 aa  751    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  25 
 
 
723 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  25.66 
 
 
712 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  25.43 
 
 
708 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  25.43 
 
 
715 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  23.37 
 
 
568 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  24.56 
 
 
694 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  22.86 
 
 
721 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  23.42 
 
 
728 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  38.66 
 
 
744 aa  96.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  22.98 
 
 
909 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  23.15 
 
 
579 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  21.78 
 
 
914 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3001  hypothetical protein  23.18 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  20.29 
 
 
827 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  22.65 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  26.32 
 
 
223 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  26.05 
 
 
929 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  22.55 
 
 
856 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0851  hypothetical protein  25.74 
 
 
665 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.170161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>