19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4558 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1344    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  80 
 
 		 711 aa  1040    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  54.56 
 
 		 587 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6412  hypothetical protein  42.98 
 
 		 725 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  45.47 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2589  hypothetical protein  44.26 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  28.6 
 
 		 909 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  28.26 
 
 		 914 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  25.62 
 
 		 929 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  26.91 
 
 		 579 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  21.63 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  25.18 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  27.11 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  34.58 
 
 		 930 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  25.98 
 
 		 728 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  24.46 
 
 		 827 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  20.34 
 
 		 736 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  24.65 
 
 		 712 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  23.81 
 
 		 223 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>