14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1276 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  100 
 
 
624 aa  1259    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  26.24 
 
 
909 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  26.66 
 
 
914 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  25.72 
 
 
929 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  25.7 
 
 
678 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  23.45 
 
 
694 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  28.52 
 
 
711 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  23.47 
 
 
827 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  40.98 
 
 
564 aa  51.2  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  30.97 
 
 
930 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6412  hypothetical protein  22.93 
 
 
725 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  21.49 
 
 
712 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  22.22 
 
 
728 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  23.36 
 
 
708 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>