14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6412 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6412  hypothetical protein  100 
 
 
725 aa  1438    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  42.05 
 
 
678 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  43.64 
 
 
711 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2777  hypothetical protein  43.71 
 
 
587 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.634317  hitchhiker  0.000903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2365  hypothetical protein  38.88 
 
 
564 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2589  hypothetical protein  37.8 
 
 
559 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325004  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  24.51 
 
 
914 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  24.52 
 
 
909 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  24.01 
 
 
929 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  24.06 
 
 
694 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1276  hypothetical protein  22.58 
 
 
624 aa  62.4  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3043  hypothetical protein  25.95 
 
 
930 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.15 
 
 
2449 aa  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  22.66 
 
 
736 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>