19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0152 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  100 
 
 
592 aa  1185    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
513 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  30.12 
 
 
531 aa  88.2  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
510 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  33.08 
 
 
618 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  34.31 
 
 
727 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  27.1 
 
 
726 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  32.23 
 
 
531 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.82 
 
 
729 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  27.03 
 
 
536 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  33.05 
 
 
516 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  33.05 
 
 
516 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  32.2 
 
 
516 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  33.05 
 
 
516 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  33.05 
 
 
516 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  32.17 
 
 
658 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  31.11 
 
 
704 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  28.06 
 
 
593 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
483 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>