47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2650 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  69.95 
 
 		 588 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  100 
 
 		 593 aa  1169    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  38.98 
 
 		 616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  36.77 
 
 		 638 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  39.34 
 
 		 526 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  37.58 
 
 		 544 aa  140  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  31.71 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  34.04 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.89 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  33.51 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  33.51 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  36.57 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  32.98 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  32.98 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  24.41 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  30.89 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  31.65 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  29.52 
 
 		 558 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  37.8 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  28.28 
 
 		 618 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  27.87 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  29.09 
 
 		 529 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  31.54 
 
 		 658 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  32.64 
 
 		 727 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 483 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  28.31 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  30.22 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  28.82 
 
 		 509 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  29.87 
 
 		 605 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 534 aa  50.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  31.91 
 
 		 546 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  31.69 
 
 		 704 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  24.18 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  28.06 
 
 		 592 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  24.18 
 
 		 557 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  27.12 
 
 		 528 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  27.12 
 
 		 528 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  26.71 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  26.71 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  28.99 
 
 		 607 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  27.55 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  28.11 
 
 		 729 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  28.47 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  34.62 
 
 		 569 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>