40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2552 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  98.67 
 
 
528 aa  1050    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  39.12 
 
 
532 aa  339  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  37.48 
 
 
533 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  37.28 
 
 
533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  37.22 
 
 
546 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  35.27 
 
 
526 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  35.63 
 
 
517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  34.56 
 
 
535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  34.28 
 
 
547 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  33.14 
 
 
546 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  33.14 
 
 
546 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  30.23 
 
 
543 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  27.87 
 
 
569 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  29.89 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  30.98 
 
 
592 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  30.98 
 
 
592 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.22 
 
 
557 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  31.17 
 
 
536 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30.26 
 
 
531 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  27.16 
 
 
531 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  29.95 
 
 
534 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  25.86 
 
 
516 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  25.86 
 
 
516 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.86 
 
 
507 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  25.86 
 
 
516 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  25.86 
 
 
516 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  25.86 
 
 
516 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  24.89 
 
 
616 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
513 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  25.78 
 
 
558 aa  53.9  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  28.86 
 
 
544 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.23 
 
 
729 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  23.58 
 
 
726 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.08 
 
 
529 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.41 
 
 
492 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  28.57 
 
 
588 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  31.62 
 
 
618 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  27.98 
 
 
523 aa  43.5  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>