51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0281 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1036    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  39.7 
 
 
532 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  36.35 
 
 
535 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  37.82 
 
 
533 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  37.23 
 
 
533 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  36.01 
 
 
528 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  36.09 
 
 
526 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  35.42 
 
 
528 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  34.14 
 
 
546 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  33.46 
 
 
547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  34.18 
 
 
546 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  34.18 
 
 
546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  30.12 
 
 
543 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  31.79 
 
 
592 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  31.79 
 
 
592 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  28.14 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  28.8 
 
 
557 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  29.29 
 
 
536 aa  80.1  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  28.47 
 
 
531 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  29.09 
 
 
605 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
513 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.98 
 
 
729 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  29.89 
 
 
558 aa  67  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  25.69 
 
 
531 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  34.12 
 
 
544 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  40 
 
 
588 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  25.6 
 
 
658 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  27.5 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  29.53 
 
 
616 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  35.66 
 
 
618 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  30.46 
 
 
618 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  23.74 
 
 
726 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  30.89 
 
 
593 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  29.51 
 
 
534 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  28.43 
 
 
516 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  28.43 
 
 
516 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  27.92 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  28.43 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  29.34 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  27.45 
 
 
607 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  31.93 
 
 
529 aa  54.3  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  26.47 
 
 
638 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  27.08 
 
 
558 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  24.84 
 
 
557 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  24.84 
 
 
557 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  26.55 
 
 
564 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  31 
 
 
563 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  35.62 
 
 
727 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  42.86 
 
 
523 aa  43.5  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>