21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2543 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  100 
 
 		 607 aa  1224    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  39.39 
 
 		 618 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.1 
 
 		 658 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  25.96 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  25.48 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  25.57 
 
 		 536 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  22.59 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  25.38 
 
 		 535 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  25.27 
 
 		 526 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  26.36 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  25 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  27.42 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  23.19 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  26.36 
 
 		 533 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  27.01 
 
 		 558 aa  51.2  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 483 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  28.87 
 
 		 546 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  28.87 
 
 		 546 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  23.96 
 
 		 729 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 510 aa  44.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  30.34 
 
 		 516 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>