34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0633 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  100 
 
 
558 aa  1122    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  31.96 
 
 
536 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  34.91 
 
 
588 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  32.9 
 
 
492 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  29.41 
 
 
517 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  26.94 
 
 
531 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
513 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  33.1 
 
 
658 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  29.94 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  31.2 
 
 
531 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.09 
 
 
607 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  33.16 
 
 
616 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  44.94 
 
 
516 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  31.89 
 
 
592 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  31.89 
 
 
592 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  44.94 
 
 
516 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  44.94 
 
 
516 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  30.18 
 
 
528 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  44.94 
 
 
516 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  44.94 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  30.18 
 
 
528 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  26.9 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  30.57 
 
 
729 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  28.03 
 
 
532 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  38.55 
 
 
618 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  35.87 
 
 
544 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  20.27 
 
 
470 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  26.54 
 
 
509 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  24.03 
 
 
533 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1269  hypothetical protein  26.47 
 
 
573 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.89 
 
 
506 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  29.44 
 
 
704 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  23.64 
 
 
533 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>