58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2647 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  74.41 
 
 		 638 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  100 
 
 		 616 aa  1211    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  39.88 
 
 		 544 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  42.2 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  39.25 
 
 		 593 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  36.61 
 
 		 588 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  30.5 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.46 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  36.71 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  36.71 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  36.97 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  36.29 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  35.86 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  28.81 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  34.46 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  29.58 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  34.95 
 
 		 492 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  23.89 
 
 		 531 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  25.29 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  25.66 
 
 		 526 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  26.29 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  33.01 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  33.49 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  25 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  33.16 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  32.28 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  24.89 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  24.89 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  39.47 
 
 		 727 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  32.96 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  28.73 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  22.9 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  25.25 
 
 		 470 aa  55.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  34.78 
 
 		 474 aa  54.3  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  32.77 
 
 		 569 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  28.77 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  29.19 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  23.78 
 
 		 557 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  28.43 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  36.79 
 
 		 565 aa  52  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  29.85 
 
 		 729 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  24.82 
 
 		 564 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  27.27 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  27.09 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  27.4 
 
 		 592 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  23.17 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  27.4 
 
 		 592 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  25.84 
 
 		 535 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7177  hypothetical protein  27.79 
 
 		 541 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.27 
 
 		 658 aa  47.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  24.35 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1163 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  25.35 
 
 		 607 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 1146 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  32.76 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>