22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0185 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  930    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  63.3 
 
 		 479 aa  551  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  54.11 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  28.13 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  30.29 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  25 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  25.56 
 
 		 516 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  35.34 
 
 		 616 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  25.28 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  22.58 
 
 		 531 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  25.28 
 
 		 516 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  30.97 
 
 		 704 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  42.74 
 
 		 638 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  30.81 
 
 		 588 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  33.04 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 618 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  33.75 
 
 		 729 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  33.7 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22231  hypothetical protein  38 
 
 		 59 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.85 
 
 		 605 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  32.87 
 
 		 726 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>