57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4444 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  997    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  43.17 
 
 		 616 aa  272  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  45.49 
 
 		 544 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  41.54 
 
 		 638 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  38.43 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  40.52 
 
 		 588 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  32.08 
 
 		 534 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30.05 
 
 		 531 aa  94  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  27.57 
 
 		 531 aa  90.5  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  34.92 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  29.48 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  29.48 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  29.48 
 
 		 516 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.1 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.08 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  34.53 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  32.56 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  37.04 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  31.82 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  33.04 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  22.77 
 
 		 507 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  30.71 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  23.85 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  24.53 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  27.91 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  25.86 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  35.75 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  27.82 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  32.56 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  32.56 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  28.96 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  27.78 
 
 		 517 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  34.25 
 
 		 727 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  34.09 
 
 		 729 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1269  hypothetical protein  29.3 
 
 		 573 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  27.54 
 
 		 618 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.46 
 
 		 605 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  27.94 
 
 		 533 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  26.96 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  30.37 
 
 		 528 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  34.64 
 
 		 558 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.62 
 
 		 658 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  26.57 
 
 		 704 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  26.72 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2637  hypothetical protein  24.53 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  28.89 
 
 		 528 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  27.86 
 
 		 535 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  26.19 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  27.64 
 
 		 726 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  31.88 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  32.88 
 
 		 557 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  32.88 
 
 		 557 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>