45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2173 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
546 aa  1099    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  38.32 
 
 
532 aa  331  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  37.65 
 
 
528 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  37.5 
 
 
528 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  34.49 
 
 
533 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  34.3 
 
 
533 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  34.42 
 
 
526 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  34.12 
 
 
535 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  34.27 
 
 
517 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  33.59 
 
 
546 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  33.48 
 
 
547 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  29.78 
 
 
543 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  27.3 
 
 
531 aa  87.8  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  33.49 
 
 
557 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  30.51 
 
 
592 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  32.13 
 
 
569 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  30.51 
 
 
592 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.3 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30 
 
 
531 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
513 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  27.06 
 
 
605 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  26.34 
 
 
558 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  26.41 
 
 
516 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  26.06 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  26.06 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  26.06 
 
 
516 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  31.64 
 
 
529 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  26.06 
 
 
516 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  25.74 
 
 
544 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  27.72 
 
 
658 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 
510 aa  53.9  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  22.8 
 
 
564 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  39.08 
 
 
506 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  26.28 
 
 
557 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  26.28 
 
 
557 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  23.75 
 
 
726 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  27.42 
 
 
534 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  32.53 
 
 
588 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  28.14 
 
 
729 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  32.98 
 
 
616 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  35.87 
 
 
492 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  25.91 
 
 
479 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  46.43 
 
 
523 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  31.33 
 
 
593 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>