36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3473 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1224    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  38.47 
 
 
557 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  36.03 
 
 
592 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  36.03 
 
 
592 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  35.4 
 
 
569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  27.42 
 
 
558 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  36.96 
 
 
528 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  36.23 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  32.31 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  30.53 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  29.54 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  26.54 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  26.45 
 
 
532 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  27.67 
 
 
564 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  28.18 
 
 
533 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  27.49 
 
 
533 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  27.06 
 
 
546 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  34.74 
 
 
492 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  26.11 
 
 
557 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  26.11 
 
 
557 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  31.15 
 
 
543 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  31.73 
 
 
563 aa  58.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  29.27 
 
 
526 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  24.22 
 
 
546 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  24.22 
 
 
546 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  28.93 
 
 
618 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  29.05 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  28.57 
 
 
588 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  30.66 
 
 
531 aa  48.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  29.87 
 
 
593 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  34.69 
 
 
616 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
483 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
513 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
510 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  24.24 
 
 
658 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  30.11 
 
 
534 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>