53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4899 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1150    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  70.28 
 
 		 593 aa  773    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  36.61 
 
 		 616 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  40.59 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  35.9 
 
 		 638 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  51.46 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  25.58 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  34.94 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  34.57 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  34.62 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  34.62 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  35.52 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  28.72 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  34.07 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  34.07 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  34.81 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  37.89 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  32.65 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  29.37 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  36.13 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  27.01 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  27.37 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  29.69 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  27.01 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  24 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  31.15 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  30.25 
 
 		 528 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  26.21 
 
 		 618 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  27.89 
 
 		 479 aa  52.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  29.93 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  29.93 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  29.82 
 
 		 532 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  29.41 
 
 		 533 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  29.38 
 
 		 569 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  28.68 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  29.79 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  29.2 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  23.42 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  32.33 
 
 		 704 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  27.37 
 
 		 729 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2568  hypothetical protein  27.93 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.777888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  25.77 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 534 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  30.81 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.07 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  30.21 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0343  hypothetical protein  25.81 
 
 		 470 aa  43.9  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.533347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>