66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1703 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  98.45 
 
 		 516 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  98.64 
 
 		 516 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  97.29 
 
 		 516 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  97.67 
 
 		 516 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  100 
 
 		 516 aa  1058    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  37.38 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  26.06 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  40.26 
 
 		 618 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 727 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  31.12 
 
 		 531 aa  87.4  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  37.21 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  24.09 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  26.75 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  27.95 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  31.84 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  34.04 
 
 		 593 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  35.52 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  37.22 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  33.58 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  32.6 
 
 		 533 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  26.74 
 
 		 546 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  32.6 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  28.02 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 618 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  34.83 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  34.09 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  27.18 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1177  beta-lactamase domain-containing protein  65.12 
 
 		 98 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  27.33 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  25.6 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  37.58 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  30.69 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  28.34 
 
 		 535 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  34.65 
 
 		 564 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 517 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  30.12 
 
 		 557 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  34.57 
 
 		 558 aa  53.9  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  27.42 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  29.05 
 
 		 592 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  29.05 
 
 		 592 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 658 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  32.52 
 
 		 592 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  28.83 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  26.6 
 
 		 726 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  28.83 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  28.99 
 
 		 547 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.97 
 
 		 605 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0185  hypothetical protein  29.94 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  30.28 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  21.94 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  39.22 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  29.93 
 
 		 607 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2778  hypothetical protein  27.69 
 
 		 513 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  23.15 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  29.93 
 
 		 729 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  33.77 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1555  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.914032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  33.77 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  27.92 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4370  hypothetical protein  30.77 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000787252  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  25.6 
 
 		 567 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>