48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1177 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1177  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  54.22 
 
 		 335 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  51.92 
 
 		 334 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  51.92 
 
 		 336 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  39.13 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  56.86 
 
 		 341 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 314 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  50 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  46.15 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 		 324 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  40.68 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  33.73 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  45.61 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  46.15 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 327 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  40.35 
 
 		 339 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  39.68 
 
 		 327 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 		 293 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 327 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  42.31 
 
 		 342 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 		 324 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 		 326 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  26.74 
 
 		 277 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 322 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  44.23 
 
 		 327 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 277 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  73.08 
 
 		 516 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  73.08 
 
 		 516 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  73.08 
 
 		 516 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  73.08 
 
 		 516 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  73.08 
 
 		 516 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 320 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  37.74 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  29.58 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 305 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1577  hypothetical protein  40.54 
 
 		 265 aa  41.2  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 313 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 329 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>