More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0821 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
324 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  81.48 
 
 
324 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  66.13 
 
 
327 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  65.18 
 
 
327 aa  434  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  54.77 
 
 
329 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  47.66 
 
 
339 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  49.22 
 
 
326 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 
335 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  46.15 
 
 
351 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  44.48 
 
 
332 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  45.25 
 
 
320 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  45.93 
 
 
342 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  43.61 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  44.14 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  46.35 
 
 
327 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  43.63 
 
 
329 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
313 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  41.9 
 
 
321 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  43.39 
 
 
322 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  44.26 
 
 
311 aa  255  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  43.69 
 
 
327 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  42.03 
 
 
348 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  42.03 
 
 
348 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  41.72 
 
 
344 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  41.61 
 
 
327 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  41.3 
 
 
328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 
324 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  40.82 
 
 
334 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  41.72 
 
 
339 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  40.82 
 
 
336 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 
341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  37.17 
 
 
281 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 
281 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 
293 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
293 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  37.59 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  38.06 
 
 
287 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  36.73 
 
 
332 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 
279 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
327 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 
287 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  36.33 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 
333 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  38.23 
 
 
290 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  36.94 
 
 
279 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  32.65 
 
 
315 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  34.69 
 
 
283 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 
336 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  37.44 
 
 
238 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
320 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  32.46 
 
 
330 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
326 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
330 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  34.48 
 
 
321 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 
315 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
322 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 
292 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 
301 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
291 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 
305 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  31.8 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
318 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
285 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 
326 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 
306 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  30.63 
 
 
277 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.38 
 
 
326 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
324 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 
315 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 
330 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.51 
 
 
329 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 
291 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
314 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.97 
 
 
293 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  29.63 
 
 
272 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
319 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
304 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.58 
 
 
311 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 
305 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  32.63 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
279 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  30.21 
 
 
311 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.49 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
310 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
310 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
308 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>