291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2787 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  78.69 
 
 
311 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  78.03 
 
 
317 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  77.38 
 
 
302 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  69.18 
 
 
306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  64.45 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  65.31 
 
 
306 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  61.59 
 
 
305 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  64.95 
 
 
308 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  64.95 
 
 
308 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  64.95 
 
 
308 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  64.26 
 
 
304 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  57.95 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  58.14 
 
 
310 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  57.81 
 
 
310 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  58.62 
 
 
310 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  58.62 
 
 
310 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  58.62 
 
 
310 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  58.62 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  56.9 
 
 
310 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  35.29 
 
 
327 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 
324 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  31 
 
 
321 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
327 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
324 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
329 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
315 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  34.48 
 
 
339 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 
326 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
336 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.51 
 
 
327 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 
334 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
329 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  30.21 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  33.56 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  30.33 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  29.39 
 
 
332 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 
311 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
329 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.41 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.63 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
324 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.66 
 
 
330 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
314 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
320 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
335 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.03 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
304 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 
329 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 
277 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  30.46 
 
 
342 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 
333 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
327 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
327 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 
315 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.27 
 
 
332 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 
330 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
330 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  29.74 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  31.4 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 
316 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.17 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.53 
 
 
327 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
341 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
293 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 
339 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  30.93 
 
 
322 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
285 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 
293 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
332 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
291 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
311 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
306 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
312 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
318 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>