274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5731 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  91.61 
 
 		 311 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  89.68 
 
 		 310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  90.65 
 
 		 310 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  89.68 
 
 		 310 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  88.06 
 
 		 310 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  88.06 
 
 		 310 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  87.1 
 
 		 310 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  62.63 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  60.55 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  60.34 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  55.52 
 
 		 317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  57.44 
 
 		 308 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  57.44 
 
 		 308 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  57.44 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  54.52 
 
 		 305 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  58.62 
 
 		 305 aa  348  8e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  54.98 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  55.86 
 
 		 302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  55.03 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  30.17 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  30 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  31.93 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.73 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  29.43 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  27.18 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 327 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  29.08 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  25.08 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  32.78 
 
 		 277 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 326 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.63 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  28.97 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  29.97 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  29.62 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  28.37 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.46 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.98 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  26.8 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  27.89 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 341 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.44 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  27.61 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  28.71 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  24.23 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>